Осуществляет координацию деятельности подведомственных Минобрнауки России организаций, закрепленных за департаментом в соответствии с приказом Минобрнауки России от 01.09.2020 № 1140 «О закреплении (кураторстве) организаций подведомственных Министерству науки и высшего образования Российской Федерации, за структурными подразделениями Министерства науки и высшего образования Российской Федерации», по вопросам эффективного использования бюджетных и иных средств, направленных на реализацию целей создания курируемых организаций, эффективного использования закрепленного за ними федерального имущества, участия курируемых организаций в процессах реструктуризации (реорганизации, ликвидации, передачи на иной уровень собственности), а также в случаях признания их несостоятельными (банкротами).